Katedra Ekonomiki i Finansów Samorządu Terytorialnego została utworzona w semestrze letnim 2001 roku. Jej powołanie było odpowiedzią na potrzeby praktyki zarządzania gospodarką i finansami samorządu terytorialnego w Polsce oraz badań naukowych w tej dziedzinie. SGH dysponowała bowiem odpowiednio wykształcona kadrą, która w większości ukończyła studia na kierunku gospodarka miejska, a doświadczenie praktyczne w zakresie gospodarki samorządu terytorialnego zdobyła na stażach zagranicznych. (USA, Niemcy, Austria) oraz w realizacji projektów USAID w Polsce. Dzięki temu pracownicy Katedry mogli kompetentnie realizować projekty dla jednostek samorządu terytorialnego i prowadzić badania wzbogacające wiedzę o problemach funkcjonowania i rozwoju tych jednostek.
Działalność Katedry nawiązuje do tradycji badań naukowych i kształcenia samorządowego zapoczątkowanych w SGH w 1915r. przez Katedrę Polityki Komunalnej (w okresie międzywojennym istniał w SGH kierunek Samorząd Terytorialny), a po wojnie od 1953 r. kontynuowany przez Katedrę Gospodarki Miejskiej, Katedrę Polityki Mieszkaniowej, a następnie przez Instytut Gospodarki Miejskiej i Polityki Mieszkaniowej. Katedra w swych obecnych badaniach poszukuje rozwiązań zwiększających efektywność i skuteczność zarządzania gospodarką samorządu terytorialnego oraz sprzyjających poprawie jakości świadczonych przez nią usług. Jej misją jest bowiem służenie praktyce i teorii gospodarowania w tej dziedzinie.