Są dwie sytuacje, gdy stosowany jest egzamin komisyjny: gdy student nie zgadza się z wystawioną mu oceną, lub gdy dziekan ma wątpliwości co do prawidłowości oceniania. Rocznie jest kilka takich przypadków. Zwyczajowo - bo nie jest to nigdzie opisane - egzamin komisyjny przeprowadza się pisemnie, tematy proponuje ktoś inny niż pierwotny egzaminator, a sprawdza niezależnie dwu egzaminatorów.